In der Natur kommt Zirkonium nicht in freier Form vor. Die Hauptquelle für den kommerziellen Abbau ist das Mineral Zirkonium, das in großen Mengen im Boden von Australien, Brasilien, Indien, Russland und den Vereinigten Staaten gefunden wird. Zirkonium ist häufig ein Nebenprodukt des Titanabbaus. Metallisches Zirkonium hat praktisch keine Auswirkungen auf den menschlichen Körper und ist daher unschädlich. Dies ist bei den meisten Zirkoniumverbindungen nicht der Fall, obwohl ihre Toxizität oft minimal ist.