Dies ist ein Metabolit (Abbauprodukt) von Histamin und wird in einem Screening auf Mastozytose, eine systemische Mastzellaktivierungsbedingung wie Anaphylaxie und andere Formen systemischer allergischer Reaktionen verwendet.

Die Bestimmung von Methylhistamin ist besonders nützlich, wenn das fäkale Histamin normal ist, aber eindeutig histaminähnliche Symptome vorliegen. Es geht mehr um ein Histaminproblem im Körper als im Darm.