Dies ist ein Enzym, auch Muramidase genannt, das die Wand eines grampositiven Bakteriums angreift. Lysozym ist daher eine antibakterielle Abwehr, die im Magen-Darm-Trakt vorhanden ist. Es wird von Granulozyten, Makrophagen, Paneth-Zellen und Brunner-Drüsen sowie normalen Dickdarm-Kryptazellen sekretiert. Die Hauptquelle für fäkales Lysozym sind die Darmgranulozyten. Es kommt in Schleimhäuten, Tränen, Blut, Speichel und Sperma vor und kommt häufig in weißen Blutkörperchen vor. Lysozym ist nützlich bei der Bestimmung der entzündlichen Aktivität im Dickdarm und nicht im Dünndarm.